Principal acteur de la prise d’Aurillac par les protestants (1569), Jean Prantinhac a très vite dû quitter une Auvergne demeurée catholique : il fit du grand sud-ouest le cadre de son action diversifiée, militaire et financière, au service du roi de Navarre, s’établit à Villemur et noua ainsi les relations qui permirent l’établissement de son fils Jean dans la haute bourgeoisie montalbanaise.

Devenu conseiller-secrétaire du roi de Navarre, ce fils s’impliqua presque immédiatement (1590) par la plume dans les argumentaires opposés à la Ligue, soutenant l’action royale dans un Traicté de l’exellence de la Monarchie française. Très actif au sein de la communauté protestante de Villemur, il montra également des préoccupations d’ordre philosophique qui, dans les années 1610, reflètent les débats au sein du calvinisme sur les contours de la « persuasion intérieure » et touchant – juste avant le synode de Dordrecht – le problème aigu de l’autorité terrestre. Mais les points de vue développés par Prantinhac dans son principal ouvrage, l’Anatomie de l’âme et de l’homme intérieur (1616), publié non loin de sa retraite saintongeoise, à Saint-Jean-d’Angely, attirèrent sur lui les foudres de la censure calviniste. Contraint par une commission de pasteurs nommés par le synode de La Rochelle à reconnaître le « caractère pernicieux » de ses écrits, il dut accepter que leurs copies soient « éteintes et supprimées ».