Paul Fagius, hébraïsant et professeur d’Ancien Testament à Strasbourg en même temps que prédicateur à Saint-Pierre-le-Jeune, a continué à enseigner à la faculté jusqu’au dernier moment avant son exil forcé de la ville et son départ avec Martin Bucer pour l’Angleterre en 1549. Des cahiers manuscrits des étudiants – dont un qu’on pensait perdu depuis la Seconde guerre mondiale – permettent d’analyser ici pour la première fois comment l’exégèse de la Genèse, du Lévitique et des Nombres a aidé à interpréter la situation tendue dans la ville, menacée par l’empereur Charles Quint et contrainte d’accepter l’Intérim de 1548 auquel Fagius et Bucer s’opposaient énergiquement. La formation des nouvelles communautés au sein de l’Église et le renforcement de la discipline se comprennent à la fois au prisme de l’histoire de Noé qui, menacé du déluge, prépare l’arche, et à celui des « ministres de Dieu » Moïse et Aaron qui exercent et prêchent la discipline comme guides du peuple élu. On est ici aux origines de l’identité d’un protestantisme d’exil réformé et de ses formes spécifiques d’expression qui marqueront la deuxième moitié du xvi^e siècle.